ADASEC PERÚ cuenta con una estructura interna que funciona entorno a la dirección principal de un Presidente, elegido por asamblea de socios y quien es la máxima jerarquía. También cuenta con un consejo directivo, cuyas funciones coinciden en la dirección de las áreas: Social, Ecológica, Cultural y Proyectos. El consejo directivo asume la gestión económica y la relación con los socios. El Consejo Ejecutivo por su parte asume el funcionamiento de las actividades internas.

La asamblea general por su cuenta aprueba los estatutos, revisa los informes económicos y elige a los integrantes del Consejo Directivo. Actualmente ADASEC PERÚ cuenta con más de 50 socios y varios colabores externos, y dispone de un equipo multidisciplinario entre médicos, psicólogos, terapeutas, ingenieros, arquitectos, economistas, contadores, administradores, entre otros.